Prinsip utama Yayasan Aqsyanna adalah rasa cinta dan hormat kepada Sang Pencipta, Allah Subhanahu Wa Ta’ala, diungkapkan melalui cinta dan hormat terhadap lingkungan yang telah dikaruniai kepada kita. Oleh karena itu, perancangan dan pembangunan RAQ Aqsyanna mengutamakan keselarasan dengan alam. Hal tersebut merupakan sebuah upaya besar yang dilakukan untuk melestarikan sebanyak mungkin kayu jati dan pohon lain yang berada di lokasi RAQ Aqsyanna.

RAQ menerapkan aturan pengelolaan sampah dan limbah serta kebijakan larangan merokok yang ketat. Selain itu memberikan edukasi dan pecerahan melalui berbagai program pemilahan sampah rumah tangga, untuk tujuan daur ulang komersial dan dana yang terkumpul akan diserahkan ke masyarakat sekitar yang membutuhkan.